誕生から12年——ドクターXの集大成、ここに極まる。
すべての秘密がいま、明かされる。
そして訪れる史上最大の危機。

フリーランスの天才外科医・大門未知子は、某国の大統領の命を救うため日本を離れていた。
その頃、東帝大学病院では、若き新病院長・神津比呂人が現れる。
比呂人は凄腕の外科医で政財界にも顔が利き、双子の弟・多可人は医療開発会社で資金のバックアップもある。
徹底的な合理化の大号令がかかり、次々とクビを切られる医師や看護師たち。
かつての同僚・森本に東帝大学病院に呼び戻された未知子は、比呂人と意気投合するが、
未知子の師匠・晶と会った比呂人は顔色を変える。
比呂人が東帝大にやってきた本当の狙いとは！？
一方、森本は未知子の過去を探りに単身、広島・呉に飛ぶ。
そこで森本は、大門未知子の知られざる誕生の秘密(ルーツ)を知ることに。
未知子、晶、比呂人の過去が絡み合う中、未知子は史上最大の危機に直面！
医師免許の剥奪も覚悟し、 “悪魔のオペ”に挑む——
「どんなに厳しいオペでも患者を見捨てない」。かつて晶が話していた言葉を胸に——