1993年の放送開始以来、幅広い世代から親しまれ続けてきたテレビアニメ「忍たま乱太郎」の劇場版

タソガレドキ忍者・諸泉尊奈門との決闘に向かった土井先生が消息を絶った。
山田先生と6年生が捜索を開始する一方、担任不在の1年は組では、タソガレドキ忍軍の忍び組頭・雑渡昆奈門と尊奈門が教壇に立つことに。
そんな中、きり丸は偶然にも、土井先生の置かれた状況を知る。
やがて土井先生を探す6年生の前に、ドクタケ忍者隊の冷徹な軍師・天鬼が出現。
その顔は、なんと土井先生と瓜ふたつだった。